تضم مستشفى كليوباترا سبع غرف للعمليات مجهزة بأحدث الأجهزة والمعدات الطبية

وذلك للقيام بجميع العمليات الكبرى والدقيقة في مختلف المجالات:
الجراحة العامة - جراحة الأوعية الدموية - جراحة الأطفال - جراحة النساء - جراحة العظام - جراحة التجميل - جراحة المخ والأعصاب - جراحة الأنف والأذن والحنجرة - جراحة العيون - جراحة العمود الفقري - جراحة المسالك البولية - جراحة الفك والأسنان.

بالإضافة إلى غرفة خاصة للقيام بعمليات القلب المفتوح وغرفة عمليات مكتملة بقسم الولادة لاستقبال مختلف الحالات، بما فيها الحالات الطارئة.